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        技术前沿
        circRNA研究汇总 | 20210419-0425
        来源: | 作者:geneseed | 发布时间: 2021-04-26 | 346 次浏览 | 分享到:

        欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计31篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

        检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

         

        1、 CircLIFRMSH2协同作用通过MutSα/ ATM-p73轴减弱膀胱癌的化疗耐药性

        标题:CircLIFR synergizes with MSH2 to attenuate chemoresistance via MutSα/ATM-p73 axis in bladder cancer

        杂志:Mol Cancer. 影响因子:15.302

        通讯作者:蒋国松教授和章小平教授(武汉协和医院)

        顺铂(CDDP)已成为肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)的标准治疗方法,而化疗耐药性仍然是主要挑战。越来越多的证据表明,环状RNAcircRNA)是独立的功能实体。然而,circRNA在调控膀胱癌CDDP的化疗耐药性和复杂性尚待充分揭示。该研究方法上通过circRNA在膀胱癌组织中的表达谱、RNA FISHcircRNA-pulldown实验、质谱分析和RIP等实验,鉴定circLIFR,并确定其与MSH2的相互作用。通过流式细胞术和功能挽救实验探索了circLIFRMSH2CDDP化疗的作用。 Co-IPwestern blot实验用于研究circLIFRMSH2功能的分子机制,肿瘤异种移植模型和PDX模型中验证circLIFRMSH2在膀胱癌中的生物学意义。研究结果表明,CircLIFR在膀胱癌中下调,其表达与预后良好相关。此外,circLIFRMSH2协同作用在膀胱癌细胞中介导CDDP敏感性,在体外和体内对CDDP的敏感性都有正向调节作用。从机制上讲,circLIFR增强了MutSα与ATM之间的相互作用,最终有助于稳定p73,从而触发癌症细胞凋亡。重要的是,在肿瘤异种移植模型和PDX模型中,circLIFRMSH2高表达的MIBC对基于CDDP的化疗更为敏感。CircLIFR可能与MSH2相互作用,通过MutSα/ ATM-p73轴在膀胱癌中正向调节CDDP敏感性。 CircLIFRMSH2可能是CDDP耐药膀胱癌的有希望的治疗靶标。

         


        图注:CircLIFR协同MSH2通过MutSα/ ATM-p73轴功能机制示意图

         

        2、环状RNA表达谱对髓母细胞瘤分型并揭示了WNT髓母细胞瘤中RMST的异常过表达

        标题:Circular RNA profiling distinguishes medullobastoma groups and shows aberrant RMST overexpression in WNT medulloblastoma

        杂志:Acta Neuropathol. 影响因子:14.251

        通讯作者: Olivier Ayrault(德国癌症研究中心)和Marc Remke(法国居里研究所)

         

        髓母细胞瘤是儿童最常见的恶性脑肿瘤。目前,髓母细胞瘤的分子分型分为WNTSHHGroup 3Group 4,可改善对肿瘤易感综合征的监测,提高对治疗干预措施的风险分层,并为靶向治疗奠定基础。 由于第3组和第4组髓母细胞瘤之间的区分使用DNA甲基化数据、基因表达谱或(磷酸化)蛋白质组学引起的部分注释不一致,因此仍然具有挑战性。 因此,越来越多的研究集成了两个或多个分子层,以便对该异质性疾病进行准确的群体评估。

        环状RNAcircRNA)最近在人类组织和癌症中作为具有细胞类型和发育阶段特异性表达模式的非常有前途的生物标志物。circRNA不易被核酸外切酶RNase R降解、半衰期长、并在体液中被广泛检测。 基于这些独特的特性,circRNA可以作为临床上有用的诊断生物标志物。 该研究开发了一种称为“ circs”的生物信息学方法,该方法结合了三种circRNA检测算法(find_circDCCCIRCexplorer),与单个circRNA检测方法相比,降低了假阳性率。利用新算法,研究者利用73例髓母细胞瘤标本的circRNA测序数据进行分析,这些标本分成独立的发现组和验证组,发现组包含38例,验证组包含35例。两组的标本不重叠。在发现组和验证组中,TOP500差异的circRNA分子进行无监督分层聚类分析揭示了四个核心组的髓母细胞瘤类型。其中,circRMSTWNT型髓母细胞瘤中特异性表达,在MiOncoCirc数据库2000例标本的数据中比较后,circRMSTWNT型髓母细胞瘤特异性的标志物分子,在其他肿瘤中表达非常低。

         


        图注:基于circRNA实现髓母细胞瘤有效分型

         

         

        3、环状RNA circMYBPC1通过靶向MyHC促进骨骼肌分化

        标题:Circular RNA circMYBPC1 promotes skeletal muscle differentiation by targeting MyHC

        杂志:Mol Ther Nucleic Acids. 影响因子:7.032

        通讯作者:Hui Li和石德顺教授(广西大学)

         

        骨骼肌发育是由一系列肌生成调节因子介导的复杂且高度协调的生物学过程。大量研究表明,环状RNAcircRNA)参与肌肉分化,但所涉及的确切分子机制仍不清楚。在这里,我们分析了牛成年和胚胎发育阶段最长肌中的circRNAs的表达。鉴定出1,318circRNA候选分子,我们发现在胚胎和成人组织之间差异表达495circRNA。随后,我们关注了表达最下调的circRNA之一(使用成年阶段的表达作为对照),并将其命名为与肌肉分化相关的环状RNAcircMYBPC1)。通过RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)和RNA-pulldown技术,鉴定出circMYBPC1通过直接结合miR-23a以减轻其对肌球蛋白重链(MyHC)的抑制作用来促进成肌细胞分化。此外,RIP分析表明circMYBPC1可以直接结合MyHC蛋白。体内观察还表明,circMYBPC1可能会在肌肉损伤后刺激骨骼肌再生。这些结果表明,新的circMYBPC1促进成肌细胞分化,并可能促进骨骼肌再生。我们的结果为深入分析circRNA在肌发生和肌肉疾病中的作用提供了基础。

         

         

        图注:安格斯牛骨骼肌中circRNA表达谱

         

        文献列表:

        序号

        主要内容

        论文标题

        杂志

        IF

        单位

        1

        CircLIFR与MSH2协同作用通过MutSα/ATM-p73轴减弱膀胱癌的化疗耐药性

        CircLIFR synergizes with MSH2 to attenuate chemoresistance via MutS伪/ATM-p73 axis in bladder cancer

        Mol Cancer.

        15.302

        武汉协和医院等

        2

        环状RNA表达谱对髓母细胞瘤分型并揭示了WNT髓母细胞瘤中RMST的异常过表达

        Circular RNA profiling distinguishes medullobastoma groups and shows aberrant RMST overexpression in WNT medulloblastoma

        Acta Neuropathol.

        14.251

        德国癌症研究中心等

        3

        环状RNA circMYBPC1通过靶向MyHC促进骨骼肌分化

        Circular RNA circMYBPC1 promotes skeletal muscle differentiation by targeting MyHC

        Mol Ther Nucleic Acids.

        7.032

        广西大学等

        4

        上调的circBACH2促进三阴性乳腺癌的细胞增殖、侵袭和迁移

        Up-regulated circBACH2 contributes to cell proliferation, invasion, and migration of triple-negative breast cancer

        Cell Death Dis.

        6.304

        郑州大学第一附属医院等

        5

        在Sertoli细胞仅存综合征中追踪环状RNA的概况和功能

        Trace the profile and function of circular RNAs in Sertoli cell only syndrome

        Genomics.

        6.205

        中南大学基础医学学院等

        6

        环状RNA:在胚胎发生、女性不育和妊娠相关疾病中的新型潜在调节剂

        Circular RNAs: Novel potential regulators in embryogenesis, female infertility, and pregnancy-related diseases

        J Cell Physiol.Review

        5.546

        安徽医科大学等

        7

        前列腺癌中雄激素受体相关的非编码RNA

        Androgen Receptor-Related Non-coding RNAs in Prostate Cancer

        Front Cell Dev Biol.Review

        5.201

        美国西北大学等

        8

        环状RNA作为黑色素瘤的潜在生物标志物:系统评价

        Circular RNA as a Potential Biomarker for Melanoma: A Systematic Review

        Front Cell Dev Biol.

        5.201

        北京协和医院等

        9

        circFBXW7通过吸附miR-942-5p减轻肺腺癌的恶性进展

        circFBXW7 attenuates malignant progression in lung adenocarcinoma by sponging miR-942-5p

        Transl Lung Cancer Res.

        5.132

        青岛大学附属医院等

        10

        有前景的骨骼和软骨疾病诊断和治疗性circRNA

        Promising diagnostic and therapeutic circRNAs for skeletal and chondral disorders

        Int J Biol Sci.Review

        4.858

        深圳市人民医院等

        11

        以m6A依赖性方式上调的CircMETTL3促进乳腺癌的进展

        CircMETTL3, upregulated in a m6A-dependent manner, promotes breast cancer progression

        Int J Biol Sci.

        4.858

        南京医科大学附属第一医院等

        12

        hsa_circ_0001836的下调通过表观遗传上调NLRP1诱导胶质瘤细胞中的凋亡。

        Downregulation of hsa_circ_0001836 Induces Pyroptosis Cell Death in Glioma Cells via Epigenetically Upregulating NLRP1

        Front Oncol.

        4.848

        西安交通大学附属第一医院等

        13

        hsa_circ_0110102通过miR-580-5p/PPARα/CCL2途径抑制巨噬细胞活化和肝癌进展

        CircRNA hsa_circ_0110102 inhibited macrophage activation and hepatocellular carcinoma progression via miR-580-5p/PPAR伪/CCL2 pathway

        Aging (Albany NY).

        4.831

        山东省立医院等

        14

        环状RNA hsa_circ_0072309通过调节miR-607/FTO轴在非小细胞肺癌中促进肿瘤发生和侵袭

        Circular RNA hsa_circ_0072309 promotes tumorigenesis and invasion by regulating the miR-607/FTO axis in non-small cell lung carcinoma

        Aging (Albany NY).

        4.831

        常州市第七人民医院等

        15

        circRNA SNRK过表达靶向miR-103-3p,以减少心肌梗死大鼠的凋亡,并通GSK3β/β-catenin途径促进心脏修复

        Overexpression of circRNA SNRK targets miR-103-3p to reduce apoptosis and promote cardiac repair through GSK3尾/尾-catenin pathway in rats with myocardial infarction

        Cell Death Discov.

        4.114

        南京医科大学附属第一医院等

        16

        环状RNA circE2F2通过与HuR蛋白结合而上调E2F2蛋白的表达,从而促进卵巢癌细胞的恶性进展

        Circular RNA circE2F2 promotes malignant progression of ovarian cancer cells by upregulating the expression of E2F2 protein via binding to HuR protein

        Cell Signal.

        3.968

        哈尔滨医科大学等

        17

        非小细胞肺癌细胞中的CircZNF208通过miR-7-5p/SNCA信号轴增强了对X射线而不是碳离子的敏感性

        CircZNF208 enhances the sensitivity to X-rays instead of carbon-ions through the miR-7-5p /SNCA signal axis in non-small-cell lung cancer cells

        Cell Signal.

        3.968

        中国科学院近代物理研究所等

        18

        研究circRNA-蛋白质相互作用的方法

        Methods to study circRNA-protein interactions

        Methods.

        3.812

        德国吉森大学等

        19

        使用环状RNA作为通读转录的标志物,以鉴定调节裂解/聚腺苷酸化事件的因子

        Use of circular RNAs as markers of readthrough transcription to identify factors regulating cleavage/polyadenylation events

        Methods.

        3.812

        宾夕法尼亚大学等

        20

        环状RNA circ_0008285调节滋养细胞的生物学功能在妊娠糖尿病中的作用

        The role of circular RNA circ_0008285 in gestational diabetes mellitus by regulating the biological functions of trophoblasts

        Biol Res.

        3.092

        中山大学附属第一医院等

        21

        LLLI通过circRNA_0001052/miR-124-3p促进BMSC增殖

        LLLI promotes BMSC proliferation through circRNA_0001052/miR-124-3p

        Lasers Med Sci.

        2.342

        云南省第一人民医院等

        22

        circRNA circFAT1(e2)通过调节miR-30e-5p和USP22促进非小细胞肺癌的发展

        circRNA circFAT1(e2) Elevates the Development of Non-Small-Cell Lung Cancer by Regulating miR-30e-5p and USP22

        Biomed Res Int.

        2.276

        上海中医药大学等

        23

        circSLC8A1通过海绵miR-21充当前列腺癌的肿瘤抑制因子

        circSLC8A1 Acts as a Tumor Suppressor in Prostate Cancer via Sponging miR-21

        Biomed Res Int.

        2.276

        郑州大学第一附属医院等

        24

        circRNA在宫颈癌中作为新型诊断生物标志物的潜力

        The Potential of circRNA as a Novel Diagnostic Biomarker in Cervical Cancer

        J Oncol.Review

        2.206

        上海华山医院等

        25

        hsa_circ_0058357作为ceRNA通过hsa?miR?24?3p/AVL9轴促进非小细胞肺癌的进展

        hsa_circ_0058357 acts as a ceRNA to promote non?small cell lung cancer progression via the hsa?miR?24?3p/AVL9 axis

        Mol Med Rep.

        2.1

        中国科学院肿瘤与基础医学研究所等

        26

        CircRNA circTRAF3通过靶向miR-203a-3p/AKT3轴促进鼻咽癌转移

        CircRNA circTRAF3 promotes nasopharyngeal carcinoma metastasis through targeting miR-203a-3p/AKT3 axis

        Pathol Res Pract.

        2.05

        中南大学湘雅医院等

        27

        Circ_0055625敲低通过调节miR-338-3p/MSI1轴抑制结肠癌的发生并提高放射敏感性

        Circ_0055625 knockdown inhibits tumorigenesis and improves radiosensitivity by regulating miR-338-3p/MSI1 axis in colon cancer

        World J Surg Oncol.

        1.963

        河北医科大学第四医院等

        28

        绝经后骨质疏松症妇女外周血单核细胞中circ_0021739的过表达与破骨细胞中microRNA-194-5p表达的降低有关

        Overexpression of circ_0021739 in Peripheral Blood Mononuclear Cells in Women with Postmenopausal Osteoporosis Is Associated with Reduced Expression of microRNA-194-5p in Osteoclasts

        Med Sci Monit.

        1.918

        哈尔滨医科大学附属第二医院等

        29

        Circ_0049447通过减少增殖、迁移、侵袭和上皮-间质转化来充当胃癌的肿瘤抑制因子

        Circ_0049447 acts as a tumor suppressor in gastric cancer through reducing proliferation, migration, invasion, and epithelial-mesenchymal transition

        Chin Med J (Engl).

        1.585

        中国医科大学第一附属医院等

        30

        沉默circ-PRKCH可防止脂多糖(LPS)引起的软骨细胞损伤和miR-140-3p/ADAM10轴对细胞外基质的破坏

        Silencing of circ-PRKCH protects against lipopolysaccharide (LPS)-evoked chondrocyte damage and extracellular matrix loss by the miR-140-3p/ADAM10 axis

        Gen Physiol Biophys.

        1.07

        潍坊市人民医院等

        31

        环状RNA的表达水平失调可作为胃癌的预后和临床病理标记:一项荟萃分析

        Dysregulated Expression Levels of Circular RNAs Serve as Prognostic and Clinicopathological Markers in Gastric Cancer: a Meta-Analysis

        Clin Lab.

        0.94

        待查

         

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